87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1859 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  199  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  66.67 
 
 		 95 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  62.22 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  38.46 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  38.64 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  38.75 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  37.65 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  30.59 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  30.43 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  30.43 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  37.78 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  40.85 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  30.77 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  37.14 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  36.67 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  28.26 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0603  protein of unknown function DUF1330  35.48 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  30 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  32.58 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  34.44 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  35.96 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  35.23 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  32.58 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1347  hypothetical protein  31.58 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  35.16 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  35.8 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  34.52 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  32 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  35.16 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  34.83 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  32.97 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  32.94 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  35.56 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  27.47 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  35 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  28.09 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  28.57 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  29.55 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  32.53 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  34.48 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  28.41 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  29.35 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  32.58 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  29.87 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  30.77 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  27.47 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  29.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  29.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  32.97 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  32.97 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  34.44 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  33.7 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  32.56 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  29.67 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  27.47 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  32.53 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  27.47 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  32.56 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  32.56 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  27.47 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  28.41 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  22.73 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  31.52 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  30.34 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  28.09 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  30.77 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  29.21 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  31.91 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  31.87 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  32.97 
 
 		 95 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  27.47 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  27.47 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  31.52 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  28.74 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  35.38 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  24.18 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5111  hypothetical protein  29.11 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>