50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0724 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  253  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2621  hypothetical protein  36.36 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.249964  normal  0.209619 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  38.75 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  40.28 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  41.1 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  37.8 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  32.94 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  37.8 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  37.8 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  39.24 
 
 
96 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  34.52 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  41.89 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  36.11 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  29.63 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  30.95 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  40.28 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  36.71 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  36.11 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  36.71 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  36.71 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  28.42 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  34.07 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  41.54 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  37.97 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  31.71 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  41.54 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  36.71 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  29.35 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  44.3 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  36.71 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  27.47 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  36.11 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  36.11 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  36.71 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  30.11 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  41.67 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  40.28 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  30.49 
 
 
96 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  40.28 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  31.65 
 
 
97 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  32.26 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  33.75 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  35.48 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  31.33 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  30.38 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  40.74 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  29.52 
 
 
134 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>