28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1128 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  280  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  57.89 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  44.36 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  43.59 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  47.79 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  39.2 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  41.23 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  38.6 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  40.35 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  34.38 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  41.23 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  41.74 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  38.84 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  36.19 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  30.83 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  37.86 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  30.71 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  32.38 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  32.71 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  34.74 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  32 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>