25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0120 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  290  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  85.82 
 
 		 142 aa  253  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  87.32 
 
 		 142 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  79.14 
 
 		 142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  59.09 
 
 		 146 aa  153  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  44.7 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  39.52 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  35.97 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  41.54 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  35.07 
 
 		 174 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  38.6 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  39.06 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  36.57 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  33.82 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  31.01 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  35.4 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  33.86 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  33.33 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  33.93 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  32.52 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  31.93 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  30.83 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  30.84 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>