25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2672 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  283  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  57.89 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  46.76 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  41.18 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  41.46 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  42.31 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  38.28 
 
 
142 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  39.06 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  38.4 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  37.93 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  33.82 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  37.4 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  38.28 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  37.72 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  35.96 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  35.82 
 
 
131 aa  57.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  31.78 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  31.3 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  30.19 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  30.48 
 
 
172 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  30.89 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  30.3 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  28.3 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>