24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1772 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  52.24 
 
 
146 aa  133  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  45.45 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  44.7 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  43.08 
 
 
142 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  43.94 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  35.66 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  40.71 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  39.53 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  32.58 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  32.8 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  34.81 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  33.08 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  30.83 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  31.3 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  30.33 
 
 
164 aa  57.4  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  33.64 
 
 
155 aa  57.4  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  30.16 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  30.16 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  30.15 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  34.17 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  29.13 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>