27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1573 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  251  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  69.17 
 
 
131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  49.04 
 
 
123 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  42.75 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  39.84 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  32.06 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  31.01 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  31.75 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  32.23 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  33.61 
 
 
174 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  31.03 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  32 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  34.62 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  31.97 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  35.09 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  31.78 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  27.21 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  32.08 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  29.85 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3507  hypothetical protein  28.04 
 
 
226 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  28.8 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  25.95 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00390  conserved hypothetical protein  24.46 
 
 
287 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  29.13 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  26.6 
 
 
140 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1706  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000036824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>