29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7652 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  290  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  83.57 
 
 
142 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  79.14 
 
 
142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  81.29 
 
 
142 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  61.07 
 
 
146 aa  157  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  43.08 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  40.3 
 
 
174 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  39.53 
 
 
134 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  35.92 
 
 
142 aa  100  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  40.46 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  40.35 
 
 
138 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  36.64 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  38.4 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  32.23 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  35.9 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  35.25 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  33.33 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  36.21 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  32.14 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  31.93 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  30.37 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  29.01 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  30.48 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  30.95 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  32.95 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  32.95 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00390  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 
287 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>