26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2404 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  357  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  56.74 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  42.54 
 
 		 134 aa  118  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  38.97 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  40.3 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  40.68 
 
 		 142 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  47.79 
 
 		 138 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  35.07 
 
 		 142 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  41.59 
 
 		 146 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  35.25 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  38.14 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  40.71 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  35.66 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  40.35 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  33.59 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  37.96 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  33.61 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  35.83 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  32.09 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  31.43 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  34.17 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  31.58 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  30.94 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00390  conserved hypothetical protein  27.66 
 
 		 287 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>