33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4004 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 
157 aa  322  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3118  protein of unknown function DUF1330  81.53 
 
 
157 aa  271  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  38.54 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2475  hypothetical protein  48.05 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  36.76 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4178  hypothetical protein  44.16 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0483142  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3704  hypothetical protein  44.16 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3777  hypothetical protein  44.16 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3717  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  34.78 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2621  hypothetical protein  33.73 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.249964  normal  0.209619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  36.92 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  28.42 
 
 
129 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  34.92 
 
 
106 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  31.65 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  38.24 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  34.33 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  32.5 
 
 
104 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  30.38 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  26.88 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  31.75 
 
 
106 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  35.29 
 
 
96 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  35.29 
 
 
96 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  46.15 
 
 
106 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  31.75 
 
 
106 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  30.12 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  25.81 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  31.34 
 
 
91 aa  40.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>