27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3118 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3118  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  81.53 
 
 
157 aa  271  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  32.35 
 
 
112 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2475  hypothetical protein  45.45 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4178  hypothetical protein  45.45 
 
 
94 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0483142  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  34.78 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3704  hypothetical protein  36.46 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3777  hypothetical protein  36.46 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3717  hypothetical protein  36.46 
 
 
95 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2621  hypothetical protein  34.94 
 
 
105 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.249964  normal  0.209619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  35.29 
 
 
100 aa  48.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  30.12 
 
 
98 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  31.11 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  32.61 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  34.92 
 
 
106 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  33.87 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  30.77 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  33.75 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  27.97 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  34.57 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  36.36 
 
 
106 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  31.65 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  35.29 
 
 
96 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  35.29 
 
 
96 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  27.85 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  29.03 
 
 
95 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>