131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4055 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  231  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3704  hypothetical protein  59.38 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3777  hypothetical protein  59.38 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3717  hypothetical protein  58.33 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2475  hypothetical protein  56.25 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4178  hypothetical protein  56.25 
 
 		 94 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0483142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  38.54 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  39.18 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  32.29 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  35.42 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  37 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  40.22 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  33.66 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  38.14 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  41.24 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  36 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  34.38 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  38.14 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  37.11 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3118  protein of unknown function DUF1330  32.35 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  34.74 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  41.05 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  39.58 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  39.58 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  39.58 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  39.58 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  34.52 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  32.97 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  32.97 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  32.94 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  37.89 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  36.84 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  45.1 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  42.86 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  33.7 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  30.3 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  41.89 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  34.44 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  35.87 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  35.87 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  35.87 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 		 95 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  45.1 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  46 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  43.04 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  28.26 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  34 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  42.59 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  40.51 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  39.24 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  32.14 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  32.99 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  32.14 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  36.84 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  32.14 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  32.29 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  34.41 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  36.96 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  36.9 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  39.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  32.29 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06361  hypothetical protein  37.35 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.481092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  31.31 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  33 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12491  hypothetical protein  35.05 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  36.9 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  38.89 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  34.78 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4724  hypothetical protein  41.77 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  32.63 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  32.32 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  31.46 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  37.04 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  27.96 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  34.02 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  41.18 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  36.23 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>