72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6638 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  98.95 
 
 		 95 aa  189  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  98.95 
 
 		 95 aa  189  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  85.26 
 
 		 95 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  78.95 
 
 		 95 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  90.36 
 
 		 84 aa  154  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  67.02 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  55.79 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3966  protein of unknown function DUF1330  53.68 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  46.32 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  45.26 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  44.74 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  37.78 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  30.53 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  35.87 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  36.56 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  34.38 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  34.38 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  40.79 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  36.46 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  37.65 
 
 		 102 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  29.17 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  35.11 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  36.71 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  45.9 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1347  hypothetical protein  35.9 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  45.9 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  34.09 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  29.17 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  28.42 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  38.16 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  32.5 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2475  hypothetical protein  41.24 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  30.12 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  29.47 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  38.16 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  34.09 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  32.94 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  34.67 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  43.08 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  35.29 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  34.69 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  36.59 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  30.43 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  39.62 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  31.03 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  30.23 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  27.84 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  34.12 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  32.63 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  31.87 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  36.49 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  34.67 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  28.57 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  30.95 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  30.11 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  30.12 
 
 		 102 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  30.12 
 
 		 102 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  30.12 
 
 		 102 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>