55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1452 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  52.75 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  52.75 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  52.75 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  45.24 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  39.56 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  30.53 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  29.76 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  31.11 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  33.73 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  29.67 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  31.11 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  26.37 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  27.96 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  35.14 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  27.96 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  31.87 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  27.96 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  32.29 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  30.34 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  27.17 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  30.43 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  36.05 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  32.14 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  27.17 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  30.14 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  34.88 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  36.99 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  29.55 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  32.93 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  30.93 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  29.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  31.87 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  30.11 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  26.32 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  27.37 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  27.08 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  33.8 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  30.68 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  33.8 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  28.09 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  30.11 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  34.09 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  30.49 
 
 		 129 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  29.21 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  27.27 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  25 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>