80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3241 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 98 aa  200  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  84.69 
 
 		 98 aa  173  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  48.94 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  46.32 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  46.32 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  43.16 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  45.26 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  44.21 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3966  protein of unknown function DUF1330  42.11 
 
 		 95 aa  87  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  44.21 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  41.46 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  39.76 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  42.68 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  38.95 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  34.83 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  34.83 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  36.46 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  38.27 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  32.29 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  35.42 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  36.46 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  37.8 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  32.98 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  31.87 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  32.58 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  33.66 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  36.05 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  32.93 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  29.21 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  31.82 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  34.15 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  29.47 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  34.88 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  36.46 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  28.42 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  35.29 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  34.88 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  31.96 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  29.55 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  31.76 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  30.95 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  32.29 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  26.04 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  34.38 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  35.09 
 
 		 112 aa  43.5  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  30.68 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  32.29 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  32.29 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  32.29 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  29.9 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  26.8 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  31.07 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  30.21 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  30.21 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  28.12 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  26.88 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3704  hypothetical protein  35.11 
 
 		 95 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  26.67 
 
 		 99 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3717  hypothetical protein  35.11 
 
 		 95 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  28.24 
 
 		 102 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  29.79 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  28.24 
 
 		 102 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3777  hypothetical protein  35.11 
 
 		 95 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  30.61 
 
 		 102 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  28.24 
 
 		 102 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  31.03 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  31 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  29.55 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  29.79 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  30.49 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>