73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0176 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 112 aa  232  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  52.69 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  52.69 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  49 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  51.61 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  45.37 
 
 		 109 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  48.39 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  50.54 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  43.43 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  42 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  43.88 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  48.39 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  39.08 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  48.61 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  35.11 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  34.04 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  34.15 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  32.47 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  28.92 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  31.91 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  31.96 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  38.71 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  31.71 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  41.46 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  29.35 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  28.42 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  30.34 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  32.5 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  28.12 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  26.09 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  32 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  26.09 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  27.03 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  31.87 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  35.48 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1800  protein of unknown function DUF1330  35.48 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472957  normal  0.250055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  38 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  27.63 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  27.55 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  36.59 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  36.59 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  36.59 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  35.09 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  33.87 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  30.65 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  27.63 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  33.87 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  29.21 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  27.63 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  30.21 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  28.38 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  31.75 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  35.19 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  24.68 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  26.6 
 
 		 95 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  34.15 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  36.59 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  25.68 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  28.72 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  25.93 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  34 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  34 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  34 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  26.04 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  31.18 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>