47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5218 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  184  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  39.36 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  36.17 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  37.23 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  37.65 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  29.47 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  29.47 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  29.47 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  29.47 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  30.85 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  30.85 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  32.63 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  31.18 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  31.87 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  30.53 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  31.11 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  36.36 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  32.94 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  32.26 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  27.66 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  30.85 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  34.07 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  31.58 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  27.17 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  33.7 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  33.7 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  30 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  30.11 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  32.29 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  31.46 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  29.67 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  34.52 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  31.52 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  27.37 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  27.78 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06361  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.481092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  28.72 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  30.11 
 
 		 99 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  25.53 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  23.4 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  28.72 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  28.26 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  27.17 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>