20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0358 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  207  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  56.18 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  56.18 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  56.18 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  51.69 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  45.24 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  38.89 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  44.62 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  43.33 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  43.33 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  40.62 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  29.89 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  31.46 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  37.33 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  41.67 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  39.39 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  32.56 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  34.15 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>