46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0458 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  221  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  35.79 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  36 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  36.51 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  38.96 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  28.87 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  31.96 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  30.53 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  32.89 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  33.68 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  33.75 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  30.59 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  34.78 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  31.58 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  29.47 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  29.17 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  30.26 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  35 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  32.26 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  32.63 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  31.33 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  30.26 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  27.78 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  30 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06361  hypothetical protein  28.12 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.481092 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  30 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  28.12 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  25.77 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  32.18 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  29.79 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  28.12 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  29.17 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  28.42 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  29.35 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  36.51 
 
 		 102 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  29.41 
 
 		 96 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>