33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2191 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 110 aa  217  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  39.58 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  36.46 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  37.21 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  39.47 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  35.11 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  32.98 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  36.51 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  31.91 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  31.18 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  28.72 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  32.26 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  34.48 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  30.53 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  32.53 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  35.19 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  29.47 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  29.47 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  30.68 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  30.68 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  30.68 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  36.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  32.18 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  33.78 
 
 		 102 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  29.03 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  29.07 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  36.11 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  32.53 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  28.24 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  26.04 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5111  hypothetical protein  41.07 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  36.63 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>