70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2304 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  80.41 
 
 
97 aa  159  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4724  hypothetical protein  77.32 
 
 
97 aa  153  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3616  hypothetical protein  74.23 
 
 
107 aa  133  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2987  protein of unknown function DUF1330  72.45 
 
 
98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  58.33 
 
 
96 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2189  protein of unknown function DUF1330  56.84 
 
 
96 aa  103  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321653  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  53.61 
 
 
97 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  49.48 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0417  hypothetical protein  54.64 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  42.71 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  43.16 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  39.36 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  39.36 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  40.62 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  39.18 
 
 
114 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  38.2 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  39.58 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  41.84 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  40.45 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  37.11 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  36.46 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  43.3 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  34.02 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  37.23 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  37.11 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  35.05 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2998  hypothetical protein  52.54 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  39.58 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  34.02 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1800  protein of unknown function DUF1330  41.24 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472957  normal  0.250055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  41.24 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  31.96 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  36.08 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  35.05 
 
 
98 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  35.05 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  34.02 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  43.04 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  37.66 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  34 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  34 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  35.71 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  37.37 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  33.68 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  37.37 
 
 
113 aa  48.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  31.25 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  31.25 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  34.34 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  36.84 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  32.29 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  33.67 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  32.29 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  33 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  38.2 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  34.12 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  31.96 
 
 
99 aa  43.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  30.93 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  32.32 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  29.9 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  31.63 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  37.08 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  31.4 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  29.9 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  29.9 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>