20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0386 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0386  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.474564  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10681  hypothetical protein  98.96 
 
 
96 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0504465 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14371  hypothetical protein  73.4 
 
 
106 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.595341  hitchhiker  0.00388009 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11051  hypothetical protein  49.46 
 
 
105 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0800045  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1029  hypothetical protein  48.39 
 
 
94 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0107339  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11111  hypothetical protein  48.39 
 
 
94 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11101  hypothetical protein  48.39 
 
 
94 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.223002  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  42.31 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  40.23 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  38.75 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06361  hypothetical protein  43.42 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.481092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  44.3 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  45.57 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  43.04 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  40.48 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  30.26 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  30.26 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  27.5 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  29.33 
 
 
95 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>