134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0248 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0248  MOFRL domain-containing protein  100 
 
 
376 aa  763    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  35.01 
 
 
417 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  36.32 
 
 
417 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0931  Hydroxypyruvate reductase  36.23 
 
 
420 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  32.13 
 
 
412 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  34.78 
 
 
410 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  32.72 
 
 
443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  32.88 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  31.4 
 
 
415 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  34.31 
 
 
446 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  32.64 
 
 
439 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  30.8 
 
 
443 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  34.72 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  32.82 
 
 
409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  32.73 
 
 
422 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  31.44 
 
 
445 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  30.71 
 
 
452 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  30.2 
 
 
486 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  28.65 
 
 
425 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  32.13 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  32.87 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  30.46 
 
 
440 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  31.84 
 
 
496 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  32.65 
 
 
446 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  30.85 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  30.13 
 
 
454 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  34.49 
 
 
413 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  31.03 
 
 
438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  31.41 
 
 
421 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  29.41 
 
 
440 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  31.29 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  29.95 
 
 
448 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  30.7 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  29.95 
 
 
428 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  30.7 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  31.55 
 
 
424 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  30.7 
 
 
424 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  30.95 
 
 
422 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  29.44 
 
 
459 aa  126  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  31.18 
 
 
625 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  29.36 
 
 
418 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  28.98 
 
 
424 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  31.86 
 
 
428 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  29.2 
 
 
448 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  30.42 
 
 
424 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  30.14 
 
 
421 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  30.92 
 
 
426 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  33.05 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  30.79 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  29.95 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  32.7 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  29.86 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  30 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  31.68 
 
 
448 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  31.65 
 
 
435 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  30.99 
 
 
421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  30.66 
 
 
460 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  28.64 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  28.39 
 
 
404 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  30.89 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  30.1 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  28.65 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  28.87 
 
 
441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1724  MOFRL domain protein  27.16 
 
 
400 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2013  hydroxypyruvate reductase  30.34 
 
 
395 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  31.51 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1043  hydroxypyruvate reductase  28.93 
 
 
448 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  30.25 
 
 
458 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  32.37 
 
 
439 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1831  Glycerate kinase  28.45 
 
 
456 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0604  Glycerate kinase  28.53 
 
 
412 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  29.26 
 
 
440 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  31.74 
 
 
424 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  27.3 
 
 
439 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  30.93 
 
 
428 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  29.3 
 
 
439 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  30.42 
 
 
447 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  29.24 
 
 
446 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  30.37 
 
 
458 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  28.67 
 
 
426 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  26.6 
 
 
442 aa  103  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  29.58 
 
 
421 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  27.68 
 
 
450 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  27.98 
 
 
432 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  29.43 
 
 
454 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  26.48 
 
 
432 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0452  MOFRL domain-containing protein  30.48 
 
 
456 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  30.27 
 
 
447 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  27.3 
 
 
419 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  29.3 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  29.18 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  30.89 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  27.56 
 
 
437 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  26.37 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2195  hydroxypyruvate reductase  31.43 
 
 
408 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384418  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  27.11 
 
 
429 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  42.75 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4079  MOFRL domain protein  29.87 
 
 
442 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.418345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  28.45 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  27.56 
 
 
437 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>