134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0806 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  100 
 
 
496 aa  961    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  55.36 
 
 
504 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  55.74 
 
 
454 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  52.42 
 
 
439 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  52.61 
 
 
443 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  43.36 
 
 
452 aa  286  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  43.67 
 
 
486 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  42.08 
 
 
443 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  48.33 
 
 
439 aa  270  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  49.35 
 
 
428 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  39.26 
 
 
443 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  45.86 
 
 
448 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  50.42 
 
 
421 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  42.13 
 
 
438 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  41.78 
 
 
421 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  47.62 
 
 
435 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  42.51 
 
 
428 aa  259  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  43.98 
 
 
424 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  45.86 
 
 
424 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  46.5 
 
 
439 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  42.51 
 
 
448 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  44.03 
 
 
447 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  43.7 
 
 
424 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  35.55 
 
 
417 aa  256  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  43.42 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  42.51 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  43.1 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  37.92 
 
 
459 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  43.45 
 
 
423 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  38.63 
 
 
417 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  43.42 
 
 
424 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  47.34 
 
 
422 aa  252  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  46.65 
 
 
317 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  45.66 
 
 
439 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  43.8 
 
 
420 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  42.06 
 
 
458 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  41.85 
 
 
422 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  44.66 
 
 
443 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  41.36 
 
 
421 aa  250  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  43.14 
 
 
421 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  43.33 
 
 
440 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  43.14 
 
 
421 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  43.57 
 
 
440 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  42.52 
 
 
446 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  44.71 
 
 
434 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  43.71 
 
 
448 aa  247  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  42.45 
 
 
432 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  47.8 
 
 
422 aa  246  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  41.78 
 
 
426 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  43.07 
 
 
418 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  39.24 
 
 
446 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  41.45 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  44.17 
 
 
440 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  41.27 
 
 
454 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  42.23 
 
 
429 aa  242  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  36.88 
 
 
412 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  43.2 
 
 
432 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  39 
 
 
409 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  41.73 
 
 
426 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  43.31 
 
 
428 aa  240  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  47.67 
 
 
437 aa  239  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  43.86 
 
 
432 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  47.51 
 
 
437 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  43.02 
 
 
411 aa  237  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  39.79 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  43.29 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  39.51 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  43.65 
 
 
434 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  42.65 
 
 
446 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  49.02 
 
 
422 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  44.54 
 
 
421 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  44.11 
 
 
451 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  44.48 
 
 
460 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  43.66 
 
 
452 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  42.86 
 
 
432 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  35.34 
 
 
415 aa  229  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  46.43 
 
 
458 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  42.46 
 
 
424 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  44.5 
 
 
437 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  43.2 
 
 
432 aa  227  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  38.68 
 
 
625 aa  227  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  42.62 
 
 
427 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  43.6 
 
 
428 aa  226  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  42.45 
 
 
444 aa  226  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  40.29 
 
 
415 aa  226  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  41.69 
 
 
374 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  39.81 
 
 
419 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  41.78 
 
 
453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  43.39 
 
 
437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  46.93 
 
 
424 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  42.48 
 
 
435 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  38.7 
 
 
420 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  42.82 
 
 
419 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  36.58 
 
 
450 aa  217  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  43.68 
 
 
439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  38.44 
 
 
412 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  44.26 
 
 
423 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  43.36 
 
 
426 aa  213  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  43.42 
 
 
423 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  44.44 
 
 
438 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.216641 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>