134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3272 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  81.66 
 
 		 458 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 458 aa  876    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  62.31 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  50.57 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  48.84 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  48.86 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  47.27 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  50.45 
 
 		 452 aa  339  7e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  46.82 
 
 		 454 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  45.06 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  45.06 
 
 		 446 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  43.48 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  43.48 
 
 		 417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  49.75 
 
 		 439 aa  318  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  49.66 
 
 		 428 aa  316  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  42.86 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  45.85 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  41.38 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  47.15 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  46.88 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  46.61 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  46.61 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  47.88 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  48.61 
 
 		 420 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  46.07 
 
 		 426 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  48.78 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  44.62 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  48.51 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  46.06 
 
 		 454 aa  292  8e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  48.51 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  46.27 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  49.33 
 
 		 504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  46.53 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  46.37 
 
 		 424 aa  282  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  45.43 
 
 		 440 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  47.7 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  46.85 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  46.86 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  46.53 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  46.57 
 
 		 421 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  48.24 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  44.06 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  45.33 
 
 		 448 aa  277  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  45.68 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  45.29 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  44.86 
 
 		 496 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  50.82 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  51.49 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  42.76 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  44.16 
 
 		 419 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  44.58 
 
 		 421 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  48.38 
 
 		 419 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  44.97 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  44.77 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  40.86 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  40.86 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  38.16 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  48.62 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  48.37 
 
 		 421 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  44.67 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  49.73 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  42.25 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  42.21 
 
 		 441 aa  259  7e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  48.41 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  46.67 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  46.65 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  42.71 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  46 
 
 		 424 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  43.39 
 
 		 432 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  38.85 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  44.07 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  44.91 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  45.72 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  43.5 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  41.28 
 
 		 421 aa  253  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  41.42 
 
 		 625 aa  251  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  46.19 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  38.58 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  46.02 
 
 		 428 aa  247  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  41.96 
 
 		 404 aa  247  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  39.65 
 
 		 442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  39.9 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  45.7 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  41.19 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  44.04 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  46.87 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  43.12 
 
 		 415 aa  242  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  43.14 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  41.49 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  44.12 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  44.65 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  42.66 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  45.48 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  39.77 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  44.12 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  43.64 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  47.99 
 
 		 424 aa  237  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  44.15 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  45.6 
 
 		 317 aa  236  8e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  44.61 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>