135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0433 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 424 aa  827    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  56.58 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  55.87 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  56.1 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  55.82 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  53 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  51.85 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  50.12 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  55.71 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  50.71 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  55.61 
 
 		 437 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  52.55 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  52.3 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  53.41 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  52.3 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  47.92 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  52.34 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  49.76 
 
 		 419 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  52.49 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  54.44 
 
 		 435 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  52.71 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  51.65 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  47.69 
 
 		 448 aa  358  9e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  49.65 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  50.47 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  47.2 
 
 		 426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  53.3 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  48 
 
 		 432 aa  354  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  54.12 
 
 		 432 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  49.43 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  53.77 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  49.41 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  47.04 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  49.88 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  49.29 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  50.47 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  48.82 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  54.77 
 
 		 421 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  46.79 
 
 		 450 aa  332  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  50 
 
 		 421 aa  332  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  48.58 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  50.46 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  48.35 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  47.75 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  48.11 
 
 		 424 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  47.75 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  47.64 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  48.71 
 
 		 423 aa  329  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  51.54 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  50.24 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  55.33 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  46.63 
 
 		 411 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  46.78 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  46.99 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  52.01 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  48.94 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  51.67 
 
 		 413 aa  309  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  47.78 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  48.42 
 
 		 374 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  44.61 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  48.95 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  48.92 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  48.82 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  44.89 
 
 		 418 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  50.23 
 
 		 439 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  49.88 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  46.23 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  47.17 
 
 		 439 aa  296  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  47.72 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  46.39 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  46.39 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  47.86 
 
 		 427 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  48.81 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  47.65 
 
 		 426 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  46.37 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  45.6 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  46.15 
 
 		 437 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  46.06 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  48.33 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  44.39 
 
 		 443 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  41.37 
 
 		 409 aa  266  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  42.2 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  41.23 
 
 		 459 aa  259  4e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  48.08 
 
 		 317 aa  259  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  41.55 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  46.07 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  46.39 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  43.96 
 
 		 452 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  46.74 
 
 		 438 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  49.03 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  43.37 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  45.9 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  46.6 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  41.01 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  41.08 
 
 		 496 aa  246  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  46.07 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  35.93 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  35.93 
 
 		 417 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  33.49 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  43.62 
 
 		 504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>