135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0377 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  91.44 
 
 		 432 aa  720    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 432 aa  855    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  96.53 
 
 		 432 aa  772    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  76.94 
 
 		 432 aa  611  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  75.82 
 
 		 437 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  54.44 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  55.58 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  54.12 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  54.5 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  58.12 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  53.58 
 
 		 438 aa  398  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  53.42 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  53.81 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  54.27 
 
 		 439 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  53.55 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  53.88 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  53.58 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  56.28 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  52.57 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  50 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  52.1 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  50 
 
 		 448 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  49.53 
 
 		 421 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  53.04 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  50.82 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  57.29 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  51.06 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  50.59 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  49.06 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  53.02 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  51.82 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  54.14 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  50.12 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  51.76 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  51.76 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  51.53 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  51.83 
 
 		 460 aa  362  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  51.76 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  51.76 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  56.87 
 
 		 421 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  49.18 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  52.16 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  54.57 
 
 		 419 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  50.63 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  48.82 
 
 		 420 aa  348  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  49.88 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  49.76 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  52.36 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  44.88 
 
 		 404 aa  343  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  48.38 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  48.27 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  46.93 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  51.06 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  50.84 
 
 		 415 aa  328  9e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  49.54 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  45.75 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  49.21 
 
 		 374 aa  319  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  50 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  49.19 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  55.95 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  50.41 
 
 		 419 aa  316  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  44.37 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  45.18 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  45.56 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  45.16 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  45.16 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  45.86 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  47.7 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  41.31 
 
 		 409 aa  282  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  48.88 
 
 		 317 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  44.7 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  41.63 
 
 		 407 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  45.96 
 
 		 447 aa  276  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  45.81 
 
 		 413 aa  275  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  41.5 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  43.1 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  45.15 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  40.71 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  42.46 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  45.11 
 
 		 427 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  47.14 
 
 		 438 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  47.09 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  46.45 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  44.56 
 
 		 486 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  44.91 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  47.71 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  45.14 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  43.55 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  42.07 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  43.2 
 
 		 496 aa  259  9e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  47.73 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  46.22 
 
 		 428 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  40.71 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  35.8 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  42.14 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  35.57 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  43.72 
 
 		 452 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  43.82 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  40.39 
 
 		 458 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  33.5 
 
 		 412 aa  242  7.999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>