136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3451 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  88.04 
 
 		 435 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  100 
 
 		 443 aa  882    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  82.01 
 
 		 439 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  80.58 
 
 		 439 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  65.94 
 
 		 446 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  68.35 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  67.63 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  66.18 
 
 		 429 aa  531  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  65.39 
 
 		 426 aa  528  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  63.29 
 
 		 432 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  66.75 
 
 		 424 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  62.04 
 
 		 438 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  66.27 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  66.27 
 
 		 424 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  66.02 
 
 		 424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  66.02 
 
 		 424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  64.07 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  63.55 
 
 		 440 aa  511  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  63.32 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  62.62 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  70.63 
 
 		 421 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  65.54 
 
 		 426 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  67.55 
 
 		 424 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  60.77 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  59.95 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  66.1 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  60.78 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  61.81 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  61.58 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  62.53 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  62.01 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  63.44 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  61.77 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  61.63 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  57.59 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  61.15 
 
 		 422 aa  441  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  54.89 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  57.01 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  57 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  54.89 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  55.13 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  56.25 
 
 		 447 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  55.56 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  56.34 
 
 		 432 aa  415  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  55.58 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  66.59 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  55.26 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  54.33 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  55.22 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  57.31 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  54.76 
 
 		 432 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  54.57 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  53.44 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  56.66 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  54.88 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  55.8 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  53.73 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  53.16 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  54.59 
 
 		 440 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  56.78 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  49.45 
 
 		 451 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  52.69 
 
 		 427 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  53.87 
 
 		 374 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  50.84 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  53.29 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  53.46 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  47.32 
 
 		 437 aa  329  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  49.16 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  47.09 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  48.71 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  53.29 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  48.37 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  48.03 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  47.18 
 
 		 443 aa  312  9e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  46.62 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  48.95 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  46.56 
 
 		 409 aa  310  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  49.88 
 
 		 438 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  47.42 
 
 		 439 aa  309  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  49.3 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  48.58 
 
 		 452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  49.88 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  47.89 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  44.7 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  53.53 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  45.56 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  47.69 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  49.18 
 
 		 428 aa  294  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  43.33 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  44.39 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  50.28 
 
 		 428 aa  286  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  49.18 
 
 		 426 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  43.94 
 
 		 454 aa  286  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0771  hydroxypyruvate reductase  68.54 
 
 		 235 aa  279  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  48.54 
 
 		 453 aa  279  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  39.24 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  43.1 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  48.78 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  39.24 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  42.76 
 
 		 486 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>