134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1889 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 450 aa  912    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  51.82 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  51.59 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  50.68 
 
 		 432 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  51.36 
 
 		 432 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  51.47 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  47.02 
 
 		 447 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  48.7 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  46.36 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  44.59 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  44.67 
 
 		 421 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  44.39 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  48.64 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  46.14 
 
 		 429 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  47.54 
 
 		 440 aa  312  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  47.54 
 
 		 440 aa  310  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  44.93 
 
 		 426 aa  306  6e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  43.84 
 
 		 432 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  45.15 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  46.09 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  46.44 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  43.79 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  45.8 
 
 		 448 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  45.5 
 
 		 438 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  44.95 
 
 		 424 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  43.6 
 
 		 418 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  44.72 
 
 		 421 aa  294  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  44.72 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  45.31 
 
 		 444 aa  293  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  44.72 
 
 		 424 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  44.5 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  46.33 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  46.26 
 
 		 439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  48.68 
 
 		 435 aa  289  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  45.8 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  42.54 
 
 		 422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  44.29 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  43.88 
 
 		 411 aa  286  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  45.43 
 
 		 448 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  47.02 
 
 		 421 aa  285  9e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  44.27 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  46.52 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  45.93 
 
 		 424 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  47.17 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  49.32 
 
 		 421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  44.95 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  44.95 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  43.81 
 
 		 419 aa  279  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  44.27 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  43.58 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  47.82 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  44.34 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  43.32 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  44.94 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  44.84 
 
 		 460 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  42.43 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  42.66 
 
 		 423 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  41 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  40.09 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  40.8 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  40.5 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  45.41 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  43.05 
 
 		 413 aa  256  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  45.72 
 
 		 419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  39.5 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  40.65 
 
 		 443 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  45.82 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  42.63 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  40.67 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  44.92 
 
 		 426 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  41.95 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  40.18 
 
 		 437 aa  242  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  41.28 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  39.95 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  43.82 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  42.93 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  39.95 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  41.59 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  38.99 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  45.65 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  37.87 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  38.22 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  43.18 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  37.69 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  39.91 
 
 		 439 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  38.83 
 
 		 446 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  39 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  42.73 
 
 		 423 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  40.89 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  39.18 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  38.67 
 
 		 458 aa  223  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  38.85 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  36.75 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  36.91 
 
 		 412 aa  221  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  36.75 
 
 		 417 aa  221  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  41.61 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  40.45 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  36.67 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  36.1 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  38.1 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>