135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0771 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0771  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 235 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  82.65 
 
 		 419 aa  307  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  82.79 
 
 		 419 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  71.43 
 
 		 428 aa  276  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  66.82 
 
 		 426 aa  274  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  72.38 
 
 		 420 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  64.93 
 
 		 432 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  66.22 
 
 		 448 aa  265  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  65.71 
 
 		 446 aa  263  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  62.5 
 
 		 440 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  62.5 
 
 		 440 aa  262  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  68.54 
 
 		 443 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  62.44 
 
 		 419 aa  259  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  68.1 
 
 		 429 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  62.27 
 
 		 438 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  63.21 
 
 		 420 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  61.5 
 
 		 440 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  64.35 
 
 		 446 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  68.87 
 
 		 439 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  67.77 
 
 		 444 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  63.3 
 
 		 424 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  63.3 
 
 		 424 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  63.3 
 
 		 424 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  63.3 
 
 		 424 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  65.14 
 
 		 422 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  66.98 
 
 		 421 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  62.39 
 
 		 426 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  57.01 
 
 		 424 aa  241  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  67.45 
 
 		 439 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  63.51 
 
 		 424 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  60.63 
 
 		 415 aa  240  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  66.82 
 
 		 435 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  55.91 
 
 		 428 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  55.91 
 
 		 448 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  56.48 
 
 		 422 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  67.14 
 
 		 435 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  63.64 
 
 		 460 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  60.96 
 
 		 448 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  62.56 
 
 		 421 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  62.56 
 
 		 421 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  63.89 
 
 		 447 aa  229  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  59.33 
 
 		 421 aa  225  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  63.08 
 
 		 424 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  57.08 
 
 		 421 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  56.6 
 
 		 424 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  67.91 
 
 		 421 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  59.52 
 
 		 411 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  60.71 
 
 		 418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  59.91 
 
 		 422 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  57.65 
 
 		 407 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  58.37 
 
 		 440 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  62.86 
 
 		 439 aa  204  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  60 
 
 		 432 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  59.26 
 
 		 432 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  67.77 
 
 		 424 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  54.21 
 
 		 423 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  61.43 
 
 		 432 aa  187  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  58.1 
 
 		 432 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  55.71 
 
 		 427 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  58.41 
 
 		 413 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  58.57 
 
 		 423 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  51.36 
 
 		 426 aa  181  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  55.88 
 
 		 434 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  50.99 
 
 		 404 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  57.28 
 
 		 437 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  54.9 
 
 		 434 aa  178  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  58.57 
 
 		 423 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  49.78 
 
 		 450 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  49.78 
 
 		 447 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  50.7 
 
 		 437 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  50.7 
 
 		 437 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  51.88 
 
 		 451 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  52.91 
 
 		 428 aa  171  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  48.83 
 
 		 439 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  50.23 
 
 		 437 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  48.48 
 
 		 443 aa  168  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  57.28 
 
 		 424 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  54.49 
 
 		 374 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  52.12 
 
 		 428 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  43.58 
 
 		 417 aa  156  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  43.58 
 
 		 417 aa  156  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  50.42 
 
 		 426 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  54.75 
 
 		 452 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  50.23 
 
 		 428 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  49.79 
 
 		 438 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  42.68 
 
 		 486 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  49.79 
 
 		 426 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  45.93 
 
 		 409 aa  148  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  40.31 
 
 		 412 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  51.35 
 
 		 439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  44.86 
 
 		 412 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  45.86 
 
 		 443 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  37.32 
 
 		 415 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  49.77 
 
 		 422 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  45.6 
 
 		 454 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  52.54 
 
 		 452 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  46.61 
 
 		 428 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  45.13 
 
 		 446 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  43.91 
 
 		 458 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  42.8 
 
 		 458 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>