134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0099 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  100 
 
 
443 aa  879    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  45.48 
 
 
417 aa  356  5e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  45.48 
 
 
417 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  44.9 
 
 
459 aa  347  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  45.37 
 
 
486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  43.91 
 
 
412 aa  337  3.9999999999999995e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  44.27 
 
 
443 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  42.6 
 
 
415 aa  331  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  45.41 
 
 
454 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  44.09 
 
 
452 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  46.29 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  46.99 
 
 
453 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  44.47 
 
 
452 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  42.99 
 
 
458 aa  295  9e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  42.48 
 
 
454 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  44.16 
 
 
428 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  41.73 
 
 
403 aa  287  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  45.06 
 
 
458 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  43.88 
 
 
441 aa  286  5e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  38.76 
 
 
446 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  45.98 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  40.91 
 
 
410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  43.61 
 
 
440 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  42.86 
 
 
440 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  44.6 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  43 
 
 
421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  40.87 
 
 
419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  43.61 
 
 
440 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  43 
 
 
446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  43.89 
 
 
443 aa  269  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  44.17 
 
 
435 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  40.81 
 
 
428 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  43.36 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  39.26 
 
 
496 aa  266  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  42.97 
 
 
429 aa  265  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  40.55 
 
 
448 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  42.75 
 
 
423 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  42.22 
 
 
424 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  40.52 
 
 
420 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  40.87 
 
 
422 aa  262  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  42.82 
 
 
420 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  40.26 
 
 
432 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  42.78 
 
 
421 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  40.1 
 
 
438 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  39.37 
 
 
424 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  41.84 
 
 
421 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  41.94 
 
 
424 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  40.45 
 
 
428 aa  259  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  42.5 
 
 
421 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  41.03 
 
 
424 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  40.84 
 
 
439 aa  258  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  43.92 
 
 
447 aa  258  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  41.73 
 
 
448 aa  257  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  40.66 
 
 
424 aa  256  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  41.39 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  43.39 
 
 
448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  40.71 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  41.39 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  41.61 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  43.89 
 
 
421 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  41.39 
 
 
424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  42.82 
 
 
419 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  40.9 
 
 
437 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  39.56 
 
 
426 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  41.67 
 
 
419 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  40.36 
 
 
432 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  42.71 
 
 
427 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  40.65 
 
 
437 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  42.28 
 
 
437 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  45.13 
 
 
422 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  41.98 
 
 
460 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  36.93 
 
 
442 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  39.43 
 
 
428 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  40.83 
 
 
426 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  40.33 
 
 
451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  38.69 
 
 
442 aa  246  6.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  41.22 
 
 
432 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  43.61 
 
 
504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  41.33 
 
 
445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  44.72 
 
 
421 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  44.23 
 
 
422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1043  hydroxypyruvate reductase  37.75 
 
 
448 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  39.34 
 
 
404 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  41.15 
 
 
437 aa  240  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  41.71 
 
 
411 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  41.34 
 
 
625 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  41.54 
 
 
439 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  42.66 
 
 
424 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  41.75 
 
 
434 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  43.11 
 
 
422 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  37.87 
 
 
450 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  43.33 
 
 
424 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  40.76 
 
 
432 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  40.55 
 
 
439 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  42.98 
 
 
440 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  40.49 
 
 
374 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  42.63 
 
 
317 aa  229  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  40.66 
 
 
435 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  37.34 
 
 
418 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  39.9 
 
 
434 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>