135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3104 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 
418 aa  828    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  59.08 
 
 
420 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  55.79 
 
 
432 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  61.26 
 
 
419 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  55.8 
 
 
446 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  58.45 
 
 
428 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  54.68 
 
 
426 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  54.91 
 
 
438 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  54.94 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  55.56 
 
 
443 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  55.18 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  57.24 
 
 
447 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  54.85 
 
 
429 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  54.7 
 
 
424 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  53.41 
 
 
440 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  54.46 
 
 
424 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  58.5 
 
 
421 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  53.52 
 
 
440 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  52.4 
 
 
421 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  56.7 
 
 
435 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  56.09 
 
 
439 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  55.06 
 
 
448 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  56.32 
 
 
439 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  53.52 
 
 
440 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  52.63 
 
 
419 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  54.11 
 
 
424 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  53.11 
 
 
420 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  54.35 
 
 
426 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  52.8 
 
 
446 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  53.94 
 
 
448 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  57.75 
 
 
435 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  52.9 
 
 
421 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  52.9 
 
 
421 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  55.45 
 
 
421 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  53.74 
 
 
460 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  50.6 
 
 
424 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  55.1 
 
 
424 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  50.12 
 
 
422 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  57.38 
 
 
419 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  54.33 
 
 
439 aa  360  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  48.92 
 
 
424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  49.29 
 
 
421 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  47.53 
 
 
428 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  47.31 
 
 
448 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  53.37 
 
 
444 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  49.76 
 
 
407 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  51.82 
 
 
415 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  60.48 
 
 
424 aa  346  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  52.18 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  50.12 
 
 
411 aa  338  8e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  51.07 
 
 
422 aa  333  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  48.34 
 
 
423 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  45.07 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  49.76 
 
 
440 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  51.46 
 
 
413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  45.99 
 
 
432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  46.35 
 
 
432 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  47.18 
 
 
437 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  45.99 
 
 
432 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  45.91 
 
 
450 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  48.56 
 
 
427 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  47.34 
 
 
374 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  46.24 
 
 
437 aa  289  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  50 
 
 
423 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  46.24 
 
 
437 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  47.71 
 
 
434 aa  285  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  48.19 
 
 
434 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  46.46 
 
 
432 aa  278  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  42.57 
 
 
451 aa  278  9e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  49.76 
 
 
423 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  45.83 
 
 
439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  45.77 
 
 
437 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  45.43 
 
 
426 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  45.58 
 
 
447 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  45.54 
 
 
428 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  45.18 
 
 
428 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  38.92 
 
 
417 aa  262  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  38.92 
 
 
417 aa  262  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  45.15 
 
 
424 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  40.43 
 
 
409 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  45.58 
 
 
426 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  40.7 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  36.08 
 
 
412 aa  254  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  43.07 
 
 
496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  40.27 
 
 
443 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  41.89 
 
 
412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  44.37 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  44.84 
 
 
452 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  44 
 
 
428 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  41.31 
 
 
486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  34.06 
 
 
415 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  44.13 
 
 
426 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  39.14 
 
 
442 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  37.34 
 
 
443 aa  235  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  39.95 
 
 
441 aa  232  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  41.15 
 
 
439 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  44.1 
 
 
428 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  42.05 
 
 
454 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  45.32 
 
 
424 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  42.34 
 
 
422 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>