134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0944 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 439 aa  876    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  50.87 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  50.61 
 
 		 454 aa  333  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  47.99 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  48.28 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  46.29 
 
 		 443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  45.92 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  47.24 
 
 		 459 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  49.25 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  49.5 
 
 		 458 aa  312  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  44.75 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  44.75 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  53.06 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  48.48 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  49.87 
 
 		 439 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  45.71 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  49.75 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  40.05 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  49.86 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  45.09 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  45.99 
 
 		 438 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  47.68 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  47.68 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  47.72 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  48.73 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  39.69 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  51.07 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  45.45 
 
 		 420 aa  276  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  46 
 
 		 424 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  47.14 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  46.3 
 
 		 422 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  48.14 
 
 		 428 aa  273  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  48.15 
 
 		 440 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  45.94 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  45.45 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  45.75 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  44.16 
 
 		 426 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  44.99 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  46.75 
 
 		 421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  45.5 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  45.5 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  45.25 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  47.76 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  46.4 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  52.32 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  46.25 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  44.92 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  42.25 
 
 		 442 aa  263  6e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  49.59 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  48.73 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  47.91 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1831  Glycerate kinase  41.19 
 
 		 456 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  50.73 
 
 		 424 aa  256  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  40.7 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  50.14 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  50.68 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  44.67 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  45.25 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  43.68 
 
 		 460 aa  253  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  47.86 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  48.44 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  40.37 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  37.81 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  45.14 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  45.77 
 
 		 434 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  47.97 
 
 		 419 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  40.81 
 
 		 441 aa  249  9e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  41.15 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  47 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  41.26 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  36.09 
 
 		 425 aa  247  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  44.67 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  43.75 
 
 		 421 aa  246  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  43.35 
 
 		 445 aa  246  8e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  45.52 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  42.66 
 
 		 496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  45.3 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  46.19 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  45.3 
 
 		 437 aa  242  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  49.84 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  47.84 
 
 		 440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  46.37 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  42.76 
 
 		 437 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  43.35 
 
 		 428 aa  239  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  44.37 
 
 		 439 aa  239  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  34.86 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  49.01 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  46.26 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  46.27 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  42.5 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  42.28 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  49.46 
 
 		 424 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  44.72 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  43.89 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  44.14 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  40.82 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  45.89 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  44.67 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  41.4 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  44.78 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>