134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1233 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  100 
 
 
441 aa  862    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  62.73 
 
 
442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  44.47 
 
 
459 aa  348  1e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  46.51 
 
 
417 aa  324  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  46.51 
 
 
417 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  40.74 
 
 
412 aa  313  4.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  38.69 
 
 
415 aa  292  8e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  43.88 
 
 
443 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  39.52 
 
 
403 aa  279  8e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  44 
 
 
453 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  42.37 
 
 
454 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  38.73 
 
 
445 aa  266  7e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  40.32 
 
 
443 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  38.17 
 
 
410 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  40.6 
 
 
458 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  43.59 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  40.91 
 
 
452 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  40.81 
 
 
439 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  37.41 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  41.15 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  37.93 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  40.36 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  39.28 
 
 
426 aa  242  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  38.07 
 
 
486 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  42.82 
 
 
422 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  38.66 
 
 
421 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  41.28 
 
 
458 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  37.12 
 
 
448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  37.12 
 
 
428 aa  236  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  42.57 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  37.27 
 
 
440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  38.48 
 
 
420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  38.4 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  39.64 
 
 
429 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  37.56 
 
 
419 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  39.29 
 
 
421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  41.98 
 
 
443 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  39.53 
 
 
420 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  39.91 
 
 
422 aa  233  7.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  39.18 
 
 
428 aa  233  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  39.95 
 
 
418 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  41.19 
 
 
439 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  39.4 
 
 
446 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  41.19 
 
 
439 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  45.31 
 
 
317 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  37.26 
 
 
422 aa  230  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  40.18 
 
 
443 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  33.85 
 
 
425 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  39.65 
 
 
440 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  36.21 
 
 
446 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  39.9 
 
 
440 aa  227  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  37.74 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  38.27 
 
 
421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  37.74 
 
 
424 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  37.93 
 
 
450 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  36.47 
 
 
424 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  39.3 
 
 
446 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  37.71 
 
 
421 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  38.02 
 
 
423 aa  225  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  35.94 
 
 
424 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  40.7 
 
 
421 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  37.5 
 
 
424 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  37.33 
 
 
432 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  35.27 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  37.26 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  39.69 
 
 
404 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  37.5 
 
 
448 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  37.64 
 
 
447 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  41.6 
 
 
419 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  41.62 
 
 
424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  40.21 
 
 
407 aa  217  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  40.97 
 
 
460 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  38.78 
 
 
424 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  38.08 
 
 
426 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  40.06 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  40.41 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  40.67 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  37.79 
 
 
432 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0604  Glycerate kinase  34.38 
 
 
412 aa  212  7.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  37.33 
 
 
432 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  36.97 
 
 
451 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  40.76 
 
 
374 aa  211  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  36.18 
 
 
442 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  38.91 
 
 
432 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  36.67 
 
 
437 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  36.45 
 
 
437 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  37.97 
 
 
424 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  38.36 
 
 
444 aa  206  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  39.69 
 
 
427 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  37.61 
 
 
437 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  37.98 
 
 
420 aa  204  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  38.73 
 
 
440 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1043  hydroxypyruvate reductase  35.29 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  40.77 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  39.69 
 
 
424 aa  199  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  38.36 
 
 
435 aa  199  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  37.44 
 
 
434 aa  199  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  33.2 
 
 
504 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  37.79 
 
 
411 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  36.59 
 
 
437 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>