133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2103 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 410 aa  833    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  53.64 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  52.78 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  50.86 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  50.86 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  45.19 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  40.91 
 
 		 443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  39.33 
 
 		 441 aa  256  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  39.45 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  39.76 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  39.34 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  37.27 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  35.45 
 
 		 486 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  36.81 
 
 		 443 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  38.04 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  36.9 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  39.73 
 
 		 453 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  36.9 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  37.27 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  38.04 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  37.85 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  37.56 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  37.7 
 
 		 458 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  37.65 
 
 		 424 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  37.53 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  37.41 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  34.4 
 
 		 439 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  38.55 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  40.69 
 
 		 458 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  38.36 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  35.38 
 
 		 422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  37.07 
 
 		 424 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  36.36 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  39.5 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  38.94 
 
 		 411 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  33.73 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  35.32 
 
 		 438 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  35.32 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  36.95 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  36.88 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  34.64 
 
 		 445 aa  213  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  36.64 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  35.73 
 
 		 432 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  36.29 
 
 		 421 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  37.22 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  36.58 
 
 		 447 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  36.32 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  33.96 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  36.87 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  35.51 
 
 		 496 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  36.21 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  37.02 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  37.02 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  36.43 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  35.56 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  35.92 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  35.08 
 
 		 423 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  33.65 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  36.88 
 
 		 437 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  34.21 
 
 		 440 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  37.09 
 
 		 435 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0604  Glycerate kinase  36.22 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  35.01 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  35.11 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  34.69 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  36.97 
 
 		 422 aa  202  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  36.8 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  36.36 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  38.06 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  36.34 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  36.67 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  35.63 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  37.04 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  36.39 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  36.08 
 
 		 440 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  37.5 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  35.98 
 
 		 625 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  35.81 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  34.16 
 
 		 504 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  34.93 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  37.15 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  35.13 
 
 		 439 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  34.84 
 
 		 428 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  34.62 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  36.49 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  36.09 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  32.61 
 
 		 422 aa  186  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  34.59 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  35.1 
 
 		 434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  34.6 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  34.72 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  34.85 
 
 		 432 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  34.76 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  36.15 
 
 		 443 aa  182  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  35.85 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  35.75 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2013  hydroxypyruvate reductase  33.41 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1043  hydroxypyruvate reductase  31.06 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  32.48 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  36.57 
 
 		 413 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>