134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2013 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2013  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 395 aa  799    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1724  MOFRL domain protein  51.11 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  37.08 
 
 		 415 aa  200  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  36.81 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  36.81 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  35.53 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  35.75 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  34.12 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  34.12 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  35.22 
 
 		 412 aa  189  7e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  37.08 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  34.27 
 
 		 427 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  35.48 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  33.41 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  37.63 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  34.68 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  33.89 
 
 		 422 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  34.4 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  34.39 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  35.98 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  35.73 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  35.65 
 
 		 424 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1043  hydroxypyruvate reductase  33.1 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  35.41 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  36 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  33.49 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  35.57 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  35.29 
 
 		 423 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  33.51 
 
 		 421 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  32.55 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  33.25 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  33.67 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  33.97 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  31.77 
 
 		 403 aa  166  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  35.16 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  33.97 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  36.11 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  32.95 
 
 		 424 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  33.25 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  34.16 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  32.75 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  34.1 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  33.64 
 
 		 459 aa  159  9e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  32.82 
 
 		 419 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  34.19 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  34.1 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  34.28 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  35.33 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  34.45 
 
 		 423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  33.68 
 
 		 446 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  35.28 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  35.1 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  35.86 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  34.78 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  35.1 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  32.9 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  31.96 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  34.24 
 
 		 460 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  33.51 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  37.87 
 
 		 413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  33.1 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  33.11 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  33.76 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  33.06 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  33.85 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  33.05 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  29.26 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  33.94 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  32.29 
 
 		 443 aa  149  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  31.19 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  34.59 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  35.84 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  35.65 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  32.78 
 
 		 504 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  31.81 
 
 		 452 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  34.9 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  34.51 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  28.67 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  34.66 
 
 		 432 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  36.81 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  34.6 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  32.02 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  33.8 
 
 		 458 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  30.33 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  34.31 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  33.33 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  34.59 
 
 		 421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  33.6 
 
 		 437 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  32.21 
 
 		 419 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  31.41 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  34.34 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  35.1 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  32.95 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  29.53 
 
 		 452 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  31.58 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  31.66 
 
 		 434 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  31.52 
 
 		 407 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  33.59 
 
 		 432 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  30.19 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  31.38 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>