135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1111 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 425 aa  845    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  35.03 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  36.29 
 
 		 422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  39.17 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  34.25 
 
 		 452 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  36.5 
 
 		 446 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  32.49 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  37.04 
 
 		 403 aa  209  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  34.32 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  35.93 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  33.85 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  32.96 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  33.72 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  30.89 
 
 		 452 aa  199  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  32.04 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  36.27 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  33.72 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  33.42 
 
 		 443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  35.66 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  29.79 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  32.71 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  32.56 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  34.65 
 
 		 440 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  36.55 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  29.64 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  33.11 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  32.41 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  32.33 
 
 		 424 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  32.18 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1043  hydroxypyruvate reductase  32.4 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  35.2 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  34.68 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  31.1 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  33.26 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  33.69 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  32.33 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  31.1 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  34.82 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  37.33 
 
 		 439 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  37.33 
 
 		 443 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  36.51 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1724  MOFRL domain protein  34.57 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  38.11 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  35.28 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  30.22 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  33.25 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  33.84 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  37.19 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  34.26 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  35.11 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  35.28 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  34.5 
 
 		 438 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  32.88 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  31.11 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  38.34 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  31.7 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  30.09 
 
 		 496 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  31.78 
 
 		 420 aa  176  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  34.27 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  32.87 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  31.45 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  31.44 
 
 		 428 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  33.18 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  33.43 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  32.56 
 
 		 446 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  31.19 
 
 		 422 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  30.95 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  32.24 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  31.98 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  35.42 
 
 		 419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  33.52 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  32.02 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  34.13 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  32.55 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  32.41 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1831  Glycerate kinase  28.08 
 
 		 456 aa  163  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  32.79 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  32.29 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  32.05 
 
 		 504 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  32.57 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  32.41 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  29.45 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  30.07 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  32.28 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  33.62 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  31.4 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  34.13 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  33.97 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  33.24 
 
 		 421 aa  156  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  30.48 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  31.53 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  35.43 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  31.95 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  29.91 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  30.41 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  34.38 
 
 		 437 aa  154  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  32.18 
 
 		 404 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  33.24 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  34.2 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  33.41 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>