136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3177 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 428 aa  840    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  74.47 
 
 		 432 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  77.16 
 
 		 429 aa  617  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  75.06 
 
 		 426 aa  612  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  72.86 
 
 		 446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  78.62 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  70.74 
 
 		 419 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  70.74 
 
 		 420 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  72.12 
 
 		 419 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  67.63 
 
 		 443 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  68.43 
 
 		 435 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  66.67 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  72.12 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  66.19 
 
 		 439 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  68.69 
 
 		 420 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  61.3 
 
 		 424 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  61.07 
 
 		 438 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  66.35 
 
 		 421 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  62 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  61.78 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  61.78 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  61.78 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  62.38 
 
 		 446 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  61.3 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  60.34 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  60.84 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  59.57 
 
 		 421 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  61.11 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  61.07 
 
 		 440 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  59.09 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  61.88 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  61.3 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  62.17 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  57.24 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  59.53 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  54.87 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  61.31 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  60.86 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  55.85 
 
 		 424 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  58.13 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  54.63 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  56.49 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  56.37 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  59.09 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  61 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  66.59 
 
 		 424 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  56.04 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  58.61 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  57.31 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  54.22 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  54.27 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  52.98 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  54.21 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  52.93 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  60.19 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  56.04 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  59.81 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  49.49 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  50.93 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  54.61 
 
 		 413 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  50.71 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  48.89 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  51.57 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  52.67 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  52.34 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  53.33 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  49.76 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  51.33 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  49.42 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  49.42 
 
 		 437 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  49.65 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  50.93 
 
 		 438 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  50.47 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  50.23 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  46.56 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  49.3 
 
 		 439 aa  309  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  47.78 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  47 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  43.43 
 
 		 459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  53.3 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  49.42 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  44.95 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  48.95 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  47.31 
 
 		 452 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  48.25 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  49.75 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  45.35 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  43.76 
 
 		 486 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  45.13 
 
 		 443 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  52.24 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  48.36 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0771  hydroxypyruvate reductase  71.43 
 
 		 235 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  39.33 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  39.33 
 
 		 417 aa  276  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  45.58 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  40.45 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  42.78 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  46.75 
 
 		 458 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  46.65 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  36.13 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>