134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2031 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 447 aa  882    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  54.42 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  54.42 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  53.9 
 
 		 439 aa  362  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  55.11 
 
 		 434 aa  360  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  53.26 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  49.32 
 
 		 447 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  53.35 
 
 		 434 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  52.89 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  48.64 
 
 		 440 aa  329  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  48.84 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  50.81 
 
 		 420 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  47.27 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  46.65 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  46.24 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  47.92 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  43.81 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  48.26 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  52.57 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  47.14 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  45.68 
 
 		 448 aa  319  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  46.91 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  47.45 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  44.68 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  45.96 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  48.17 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  43.39 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  46.44 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  43.32 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  50.23 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  43.32 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  47.9 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  48.71 
 
 		 419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  50.58 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  46.54 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  45.69 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  48.6 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  47.5 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  46.53 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  44.47 
 
 		 424 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  41.9 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  49.18 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  44.47 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  46.87 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  41.9 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  42.62 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  45.58 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  44.24 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  44.24 
 
 		 424 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  45.96 
 
 		 432 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  46.68 
 
 		 407 aa  296  7e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  48.84 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  44.04 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  47.59 
 
 		 437 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  49.32 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  43.49 
 
 		 422 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  45.41 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  42.79 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  41.49 
 
 		 424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  45.73 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  46.74 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  43.36 
 
 		 421 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  43.96 
 
 		 451 aa  282  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  46.54 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  47.93 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  42.89 
 
 		 421 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  46.56 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  43.52 
 
 		 421 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  47.31 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  46.33 
 
 		 422 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  51.51 
 
 		 424 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  42.12 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  45.43 
 
 		 424 aa  272  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  43.16 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  44.73 
 
 		 415 aa  269  8e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  46.45 
 
 		 424 aa  264  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  41.03 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  49.07 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  44.16 
 
 		 422 aa  250  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  43.19 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  40.05 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  40.95 
 
 		 424 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  43.28 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  39.5 
 
 		 443 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  42.99 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  42.25 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  42.86 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  38.57 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  35.1 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  42.13 
 
 		 496 aa  226  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  41.16 
 
 		 454 aa  223  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  43.41 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  35.33 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  46.37 
 
 		 317 aa  219  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  36.49 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  41.58 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  41.88 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  39.05 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  33.65 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  38.02 
 
 		 459 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>