135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0463 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 
437 aa  861    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  83.64 
 
 
432 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  75.82 
 
 
432 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  74.65 
 
 
432 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  76.29 
 
 
432 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  53.78 
 
 
451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  53.38 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  54.94 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  54.46 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  54.02 
 
 
446 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  54.05 
 
 
440 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  50.69 
 
 
428 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  54.57 
 
 
443 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  51.62 
 
 
421 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  53.51 
 
 
448 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  50.46 
 
 
448 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  51.62 
 
 
421 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  50.7 
 
 
421 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  52.57 
 
 
446 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  50.58 
 
 
424 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  53.95 
 
 
439 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  52.68 
 
 
447 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  52.21 
 
 
424 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  54.72 
 
 
420 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  51.41 
 
 
424 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  51.59 
 
 
450 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  52.21 
 
 
424 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  51.98 
 
 
424 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  51.75 
 
 
424 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  53.26 
 
 
439 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  51.75 
 
 
424 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  54.21 
 
 
435 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  51.05 
 
 
426 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  49.53 
 
 
432 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  54.99 
 
 
421 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  48.72 
 
 
419 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  48.71 
 
 
426 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  50.81 
 
 
421 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  50.93 
 
 
429 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  49.77 
 
 
422 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  50 
 
 
423 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  54.67 
 
 
424 aa  362  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  52.68 
 
 
424 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  48.83 
 
 
420 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  54.78 
 
 
419 aa  359  6e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  50.93 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  51.94 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  51.75 
 
 
444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  54.21 
 
 
421 aa  349  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  52.57 
 
 
422 aa  343  5e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  47.14 
 
 
424 aa  342  5.999999999999999e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  50 
 
 
415 aa  339  7e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  51.28 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  45.15 
 
 
404 aa  335  9e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  47.85 
 
 
422 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  50.68 
 
 
435 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  48.45 
 
 
411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  52.21 
 
 
419 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  56.42 
 
 
424 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  46.95 
 
 
418 aa  326  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  48.68 
 
 
374 aa  322  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  50 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  49.88 
 
 
422 aa  318  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  47.71 
 
 
437 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  47.71 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  50.93 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  47.53 
 
 
434 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  47.02 
 
 
437 aa  299  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  42.42 
 
 
409 aa  295  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  47.53 
 
 
434 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  47.02 
 
 
428 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  43.79 
 
 
407 aa  288  9e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  43.94 
 
 
443 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  48.24 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  42.28 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  45.23 
 
 
439 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  46.44 
 
 
447 aa  279  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  49.21 
 
 
317 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  42.21 
 
 
446 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  43.05 
 
 
452 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  40.09 
 
 
459 aa  269  7e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  44.31 
 
 
458 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  45.77 
 
 
427 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  43.56 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  44.11 
 
 
454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  47.03 
 
 
438 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  42.95 
 
 
439 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  40.58 
 
 
486 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  46.88 
 
 
428 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  46.21 
 
 
426 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  38.86 
 
 
417 aa  257  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  38.86 
 
 
417 aa  257  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  45.67 
 
 
423 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  42.51 
 
 
496 aa  253  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  44.47 
 
 
458 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  45.21 
 
 
426 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  45.77 
 
 
428 aa  247  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  44.03 
 
 
452 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  35.77 
 
 
412 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  44.68 
 
 
504 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>