134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56499 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  100 
 
 		 625 aa  1257    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  41.34 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  39.28 
 
 		 486 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  44.04 
 
 		 504 aa  259  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  38.68 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  35.23 
 
 		 459 aa  251  3e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  38.89 
 
 		 417 aa  249  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  38.89 
 
 		 417 aa  249  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  37.12 
 
 		 443 aa  243  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  37.95 
 
 		 415 aa  239  9e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  38.98 
 
 		 448 aa  237  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  41.08 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  40.77 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  38.57 
 
 		 454 aa  233  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  38.75 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  39.04 
 
 		 454 aa  231  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  41.81 
 
 		 458 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  38.96 
 
 		 452 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  37.5 
 
 		 446 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  35.12 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  41.15 
 
 		 439 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  41.06 
 
 		 447 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  37.95 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  35.98 
 
 		 410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  37.73 
 
 		 421 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  38.15 
 
 		 424 aa  213  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  39.12 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  33.26 
 
 		 403 aa  210  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  38.75 
 
 		 443 aa  210  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  37.92 
 
 		 422 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  37.7 
 
 		 432 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  37.73 
 
 		 432 aa  203  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  36.81 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  38.64 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  38.32 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  38.13 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  37.18 
 
 		 404 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  38.8 
 
 		 420 aa  200  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  32.67 
 
 		 442 aa  200  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  38.08 
 
 		 432 aa  200  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  36.26 
 
 		 441 aa  198  3e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  37.53 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  38.13 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  37.88 
 
 		 424 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  37.88 
 
 		 424 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  39.49 
 
 		 423 aa  197  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  39.12 
 
 		 428 aa  197  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  37 
 
 		 432 aa  197  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  36.93 
 
 		 424 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  39.39 
 
 		 439 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  38.23 
 
 		 426 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  36.55 
 
 		 424 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  35.24 
 
 		 450 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  38.07 
 
 		 434 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  36.64 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  37.72 
 
 		 435 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  35.2 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  37.88 
 
 		 411 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  40.88 
 
 		 422 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  36.51 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  36.53 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  38.69 
 
 		 446 aa  190  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  37.06 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  39.7 
 
 		 374 aa  189  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  38.69 
 
 		 428 aa  188  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  37.97 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  38.98 
 
 		 446 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  38.39 
 
 		 434 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  36.32 
 
 		 418 aa  187  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  36.6 
 
 		 440 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  41.06 
 
 		 422 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  38.54 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  37.16 
 
 		 440 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  36.13 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  36.67 
 
 		 437 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  39.35 
 
 		 419 aa  180  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  36.66 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  40.3 
 
 		 421 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  36.36 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  38.05 
 
 		 448 aa  178  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  33.86 
 
 		 424 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  37.57 
 
 		 421 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  36.83 
 
 		 421 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  38.32 
 
 		 419 aa  176  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  40.66 
 
 		 420 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  35.01 
 
 		 447 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  34.23 
 
 		 409 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  38.78 
 
 		 317 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  35.83 
 
 		 419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1043  hydroxypyruvate reductase  34.32 
 
 		 448 aa  173  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  37.06 
 
 		 415 aa  173  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  36.62 
 
 		 437 aa  173  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  35.84 
 
 		 442 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  38.84 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  36.36 
 
 		 420 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  37.64 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  37.09 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  35.25 
 
 		 427 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  36.36 
 
 		 426 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  36.82 
 
 		 439 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>