134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2195 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2195  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 408 aa  757    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  52.34 
 
 		 420 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  36.63 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  36.63 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  33.57 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  38.46 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  37 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  34.83 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  33.68 
 
 		 403 aa  199  9e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  41.16 
 
 		 420 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  36.09 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  37.96 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  37.67 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  35.36 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  40.32 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  40.4 
 
 		 453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  35.97 
 
 		 459 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  41.1 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  38.15 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  39.73 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  41.37 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  29.51 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  38.74 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  37.85 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  39.9 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  39.39 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  34.17 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  39.29 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  41.31 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  39.67 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  39.8 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  37.94 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  39.58 
 
 		 422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  38.04 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  37.4 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  36.78 
 
 		 423 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  39.01 
 
 		 424 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  39.29 
 
 		 424 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  38.97 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  39.65 
 
 		 443 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  36.23 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  38.08 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  35.92 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1043  hydroxypyruvate reductase  34.54 
 
 		 448 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  39.6 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  35.77 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  37.5 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  37.56 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  43.1 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  38.64 
 
 		 440 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  37.5 
 
 		 437 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  37.94 
 
 		 439 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  34.74 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  40.87 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  35.52 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  35.52 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  38.5 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  36.95 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  37.09 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  41.96 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  37.41 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  35.05 
 
 		 418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  37.23 
 
 		 432 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  40.28 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  40.98 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  38.44 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  36.65 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  35.7 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  35.73 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  35.93 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  39.65 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  38.73 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  37.93 
 
 		 437 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  39.23 
 
 		 460 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  38 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  37.18 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  34.85 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  37.88 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  38.29 
 
 		 496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  35.8 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  36.28 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  40.76 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  40.86 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  40.24 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  34.65 
 
 		 424 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  40.77 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  38.42 
 
 		 421 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  37.74 
 
 		 444 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  36.98 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  36.82 
 
 		 434 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2496  MOFRL domain protein  38.52 
 
 		 462 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.784601  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  36.34 
 
 		 446 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  37.87 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  39.95 
 
 		 438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  31.41 
 
 		 445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  35.97 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  35.84 
 
 		 438 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  38.98 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  37.64 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  37.35 
 
 		 625 aa  144  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>