More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0073 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0073  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  323  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.25 
 
 
400 aa  222  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65 
 
 
406 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.38 
 
 
412 aa  219  9e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.88 
 
 
404 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65 
 
 
400 aa  218  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.38 
 
 
401 aa  218  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  65 
 
 
400 aa  218  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.75 
 
 
400 aa  218  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.12 
 
 
400 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.41 
 
 
403 aa  216  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.5 
 
 
400 aa  216  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  63.69 
 
 
401 aa  216  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.38 
 
 
400 aa  215  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.25 
 
 
400 aa  215  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.75 
 
 
403 aa  215  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.38 
 
 
401 aa  215  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.45 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.75 
 
 
406 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.5 
 
 
400 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1198  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.5 
 
 
401 aa  212  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  212  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.12 
 
 
401 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.66 
 
 
401 aa  211  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.5 
 
 
402 aa  210  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  209  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  210  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
405 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
405 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.64 
 
 
401 aa  208  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
405 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.5 
 
 
404 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
405 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
400 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.88 
 
 
402 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.39 
 
 
401 aa  207  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60 
 
 
400 aa  207  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.25 
 
 
406 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.25 
 
 
400 aa  207  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.25 
 
 
400 aa  207  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.75 
 
 
400 aa  207  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.25 
 
 
406 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.25 
 
 
405 aa  206  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.15 
 
 
401 aa  206  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.15 
 
 
401 aa  206  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.15 
 
 
401 aa  206  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.15 
 
 
401 aa  206  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.78 
 
 
400 aa  205  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
402 aa  205  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.75 
 
 
401 aa  202  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.15 
 
 
400 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.38 
 
 
400 aa  202  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0916  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.78 
 
 
400 aa  202  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.58 
 
 
401 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  61.69 
 
 
399 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.94 
 
 
401 aa  201  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.5 
 
 
401 aa  201  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2871  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.12 
 
 
403 aa  201  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3548  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.12 
 
 
403 aa  200  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608439  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.69 
 
 
399 aa  200  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.87 
 
 
401 aa  199  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.75 
 
 
399 aa  197  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.03 
 
 
401 aa  197  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.65 
 
 
401 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.38 
 
 
400 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  56.25 
 
 
404 aa  196  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60 
 
 
400 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
406 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1847  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.5 
 
 
400 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.227996  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.13 
 
 
401 aa  194  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60 
 
 
400 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.12 
 
 
401 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.75 
 
 
399 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.25 
 
 
400 aa  194  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0447  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0472  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.62 
 
 
400 aa  193  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0423781  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.12 
 
 
400 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.88 
 
 
400 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.86 
 
 
402 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3817  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.23 
 
 
400 aa  192  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342628  normal  0.265145 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.12 
 
 
400 aa  192  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.49 
 
 
401 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.25 
 
 
400 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000820943  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.01 
 
 
405 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>