177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3504 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3504  cytochrome C biogenesis protein  100 
 
 
171 aa  353  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.813112  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2668  cytochrome C biogenesis protein  42.42 
 
 
158 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1376  cytochrome C biogenesis protein  36.02 
 
 
157 aa  94  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0033  cytochrome C biogenesis protein  41.53 
 
 
170 aa  94  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00807478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1508  cytochrome C biogenesis protein  31.48 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2392  cytochrome c biogenesis protein  42.73 
 
 
151 aa  91.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00556293  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1072  cytochrome C biogenesis protein  36.84 
 
 
151 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.777524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4994  cytochrome C biogenesis protein  45.35 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3890  cytochrome C biogenesis protein  38.6 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0293402  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0923  cytochrome C biogenesis protein  33.11 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353367  normal  0.0366551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0900  cytochrome C biogenesis protein  34.92 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  40.82 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1365  cycL protein  37.33 
 
 
152 aa  87.4  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00486765  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1209  C-type cytochrome biogenesis protein  45.45 
 
 
154 aa  87.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3447  cytochrome C biogenesis protein  34.35 
 
 
166 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.345462  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_004310  BR0610  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  39.8 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3998  cytochrome C biogenesis protein  37.17 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal  0.946907 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0376  putative cytochrome C biogenesis protein CcmH  43.68 
 
 
164 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0115761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3997  transcriptional regulator, XRE family  43.81 
 
 
201 aa  84.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0925  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  38.1 
 
 
133 aa  84.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0894  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  38.1 
 
 
133 aa  84.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0220  cytochrome C biogenesis protein  37.6 
 
 
155 aa  84  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000296906  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0942  cytochrome C biogenesis protein  35.83 
 
 
157 aa  84  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0762441  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0250  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  32.53 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000345398  normal  0.0777875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0636  cytochrome C biogenesis protein  39.8 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141803  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3564  cytochrome C biogenesis protein  34.18 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000181195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2004  cytochrome C biogenesis protein  35.43 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0941  cytochrome C biogenesis protein  37.7 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.124788 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1511  cytochrome C biogenesis protein  35.59 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2274  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH precursor  34.15 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4019  cytochrome c nitrite reductase, accessory protein NrfF  31.25 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000231176  hitchhiker  0.00651067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2233  cytochrome C biogenesis protein  40.82 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0233  cytochrome C biogenesis protein  31.25 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000146648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0236  cytochrome C biogenesis protein  31.25 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000417062  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1170  cytochrome C biogenesis protein  42.55 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0233  cytochrome C biogenesis protein  31.25 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000012356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3845  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  33.86 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0439  cytochrome C biogenesis protein  37.23 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2784  cytochrome C biogenesis protein  34.56 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1658  cytochrome C biogenesis protein  43.59 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242206  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45290  cytochrome C-type biogenesis protein CcmH  34.11 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2133  cytochrome C biogenesis protein  34.11 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3386  cytochrome C biogenesis protein  34.92 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.255579  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002848  cytochrome c heme lyase subunit CcmL  31.82 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0941  cytochrome C biogenesis protein  38.89 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0853433  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1207  cytochrome C biogenesis protein  33.33 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1584  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase, 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  28.93 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.550615  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3384  cytochrome C biogenesis protein  35.25 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30380  Cytochrome C biogenesis protein  30.2 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404014  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3409  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  33.9 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0284727  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0184  cytochrome C biogenesis protein  29.37 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4202  cytochrome c-type biogenesis protein H2  33.88 
 
 
347 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4095  cytochrome c-type biogenesis protein H2  33.88 
 
 
347 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00858  C-type cytochrome biogenesis protein  38.18 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00749926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06069  C-type cytochrome biogenesis protein  38.18 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000842806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2590  cytochrome c-type biogenesis protein H2  33.88 
 
 
347 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.124545 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2431  cytochrome c-type biogenesis protein H2  33.88 
 
 
347 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.684186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2448  cytochrome C biogenesis protein  37.25 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4053  cytochrome C biogenesis protein  35.82 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.448271  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2634  cytochrome c maturation protein, CcmH  34.65 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1371  cytochrome C biogenesis protein  32.14 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3777  cytochrome C biogenesis protein  35.82 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03128  hypothetical protein  31.54 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2487  cytochrome c-type biogenesis protein H2  33.61 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  hitchhiker  0.00973673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4040  cytochrome c-type biogenesis protein H1  33.61 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1689  cytochrome C biogenesis protein  42.47 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.320288  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2854  cytochrome C biogenesis protein  37.21 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0038  cytochrome C biogenesis protein  33.77 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4144  cytochrome c-type biogenesis protein H2  33.61 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4023  cytochrome c-type biogenesis protein H2  33.61 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2930  cytochrome C biogenesis protein  36.19 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.344333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1291  cytochrome C biogenesis protein  35.59 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0195  cytochrome C biogenesis protein  31.4 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00319967  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1638  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  31.62 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00720006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2473  cytochrome c-type biogenesis protein H2  33.61 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.677618  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2382  cytochrome c-type biogenesis protein H1  33.61 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1680  cytochrome C biogenesis protein  37.19 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.456751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3992  cytochrome C biogenesis protein  33.33 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1405  cytochrome C biogenesis protein  37.19 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.469945  normal  0.0182581 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1249  cytochrome C biogenesis protein  32.97 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.882215  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3249  cytochrome C biogenesis protein  34.69 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3017  cytochrome C biogenesis protein  32.63 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4654  cytochrome c nitrite reductase, accessory protein NrfF  28.21 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532931  normal  0.0226241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03067  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  35.42 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0433  cytochrome c-type biogenesis protein CycL  33.62 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3722  cytochrome C biogenesis protein  30.91 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000413859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1503  cytochrome C biogenesis protein  35.63 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1400  cytochrome C biogenesis protein  37.7 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287486  normal  0.0562024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1394  putative cytochrome c-type biogenesis protein  35.63 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0842  cytochrome C biogenesis protein  44.44 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1657  cytochrome C biogenesis protein  36.55 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.282242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3408  cytochrome C biogenesis protein  31.06 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.572276  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02121  heme lyase, CcmH subunit  34.44 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1465  cytochrome C biogenesis protein  34.44 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1456  cytochrome C biogenesis protein  34.44 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1567  cytochrome C biogenesis protein  34.62 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0747  cytochrome c-type biogenesis family protein  34.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2332  cytochrome c-type biogenesis family protein  34.44 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2342  cytochrome c-type biogenesis family protein  34.44 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2493  cytochrome c-type biogenesis family protein  34.44 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>