122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3155 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3155  transcriptional regulator-like  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.221004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  33.53 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05600  Negative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.592075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3679  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3641  negative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.691719  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  28.86 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.05 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.61 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0320  negative transcriptional regulator  31.51 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  31.65 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  26.6 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.94 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.94 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.05 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  30.38 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.34 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0716  FMN-binding negative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50195  predicted protein  21.47 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4489  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  26.86 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.79 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  26.99 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  25.84 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  24.37 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  26.58 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  26.58 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  26.58 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  24.16 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  25.14 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  24.61 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.7 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  23.78 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  26.42 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  24.19 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  25.6 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  24.26 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  24.26 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  23.74 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  24 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  24 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  24 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  24.26 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  24.26 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.6 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  24 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  24 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  26.21 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.91 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  22.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2445  negative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  24.56 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  22.75 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2487  negative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.234096 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0621  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.609776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>