136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0662 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  77.08 
 
 
211 aa  297  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  58.03 
 
 
210 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  49.75 
 
 
205 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  50 
 
 
251 aa  202  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  54.45 
 
 
207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  49.76 
 
 
213 aa  197  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  52.33 
 
 
212 aa  197  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.78 
 
 
212 aa  195  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  47.69 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  51.94 
 
 
208 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  51.46 
 
 
208 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  53.68 
 
 
209 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1141  FMN-binding negative transcriptional regulator  48.77 
 
 
212 aa  187  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  48.31 
 
 
213 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  47.14 
 
 
212 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.26 
 
 
227 aa  184  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  49 
 
 
218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  47.24 
 
 
216 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  47.47 
 
 
219 aa  181  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.47 
 
 
219 aa  181  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  47.24 
 
 
212 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  48.17 
 
 
210 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  46.7 
 
 
212 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  48.02 
 
 
214 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.45 
 
 
212 aa  177  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  46.46 
 
 
218 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  46.46 
 
 
218 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  46.46 
 
 
218 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  50.26 
 
 
207 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.76 
 
 
216 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  45.73 
 
 
210 aa  175  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.36 
 
 
208 aa  175  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  46.11 
 
 
212 aa  174  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.96 
 
 
212 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.96 
 
 
212 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  46.7 
 
 
212 aa  174  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.6 
 
 
223 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.89 
 
 
211 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  44.72 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.37 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  47.15 
 
 
217 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  43.96 
 
 
212 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.63 
 
 
206 aa  170  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  45.23 
 
 
212 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  45.23 
 
 
253 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  45.23 
 
 
212 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  45.23 
 
 
212 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  45.23 
 
 
212 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  45.23 
 
 
212 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  45.23 
 
 
212 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  46.94 
 
 
216 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  45.81 
 
 
223 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  46.19 
 
 
207 aa  168  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  42 
 
 
216 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.71 
 
 
214 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.96 
 
 
209 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  43.4 
 
 
212 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  43.4 
 
 
212 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.87 
 
 
212 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  37.76 
 
 
202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  44.95 
 
 
209 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  46.15 
 
 
209 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.27 
 
 
207 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  43.13 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50195  predicted protein  37.56 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273335  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  46.15 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  43.41 
 
 
212 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.41 
 
 
212 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.93 
 
 
209 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.92 
 
 
207 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  44.44 
 
 
218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.8 
 
 
212 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.42 
 
 
200 aa  141  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.170133 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10108  Uncharacterized protein AN0679 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C154]  39.21 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254579  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.9 
 
 
224 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  32.54 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.53 
 
 
202 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.82 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06510  conserved hypothetical protein  35.98 
 
 
247 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.962435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  33.17 
 
 
199 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  38.12 
 
 
201 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  33.17 
 
 
199 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  33.17 
 
 
199 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.81 
 
 
204 aa  121  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  31.88 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.81 
 
 
217 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0083  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.78 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  32.47 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.59 
 
 
205 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  31.98 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  30.93 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  35.41 
 
 
206 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.81 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  30.41 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3641  negative transcriptional regulator  37.5 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.691719  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.9 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  30.41 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.12 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.12 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>