138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3223 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  87.94 
 
 
199 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  87.94 
 
 
199 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  87.44 
 
 
219 aa  367  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  87.44 
 
 
199 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  86.43 
 
 
199 aa  359  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  85.93 
 
 
199 aa  358  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2362  FMN-binding negative transcriptional regulator  59.2 
 
 
203 aa  228  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.07 
 
 
200 aa  184  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  43 
 
 
202 aa  177  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3525  transcriptional regulator, putative  84 
 
 
100 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.72 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  45.1 
 
 
205 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  40.8 
 
 
207 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  40.3 
 
 
207 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  40.3 
 
 
207 aa  148  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  41.54 
 
 
202 aa  148  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  40.3 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.8 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.8 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.8 
 
 
207 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  38.76 
 
 
212 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.9 
 
 
204 aa  141  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  38.16 
 
 
217 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  39.5 
 
 
227 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  39.5 
 
 
227 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.38 
 
 
227 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.62 
 
 
224 aa  137  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.08 
 
 
205 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.27 
 
 
207 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  36.18 
 
 
214 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5889  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.63 
 
 
207 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  38.5 
 
 
227 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.12 
 
 
207 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  89.71 
 
 
86 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  37.38 
 
 
212 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  36.71 
 
 
208 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.68 
 
 
208 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  40.32 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  36.45 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.62 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.16 
 
 
208 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.58 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  38.86 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.95 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.82 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.12 
 
 
207 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.47 
 
 
210 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.6 
 
 
211 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.05 
 
 
207 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  36.98 
 
 
205 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.11 
 
 
211 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  35.15 
 
 
206 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.71 
 
 
218 aa  121  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  35.71 
 
 
218 aa  121  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.71 
 
 
218 aa  121  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  32.85 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1141  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.87 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  35.96 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  36.52 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.96 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.7 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  36.13 
 
 
201 aa  118  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  34.34 
 
 
218 aa  117  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  34.91 
 
 
212 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.4 
 
 
206 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.28 
 
 
216 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.85 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.33 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.33 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  32.99 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.52 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.48 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  30.96 
 
 
212 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  31.71 
 
 
232 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.73 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.69 
 
 
209 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3641  negative transcriptional regulator  33.17 
 
 
210 aa  111  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.691719  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0716  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.48 
 
 
236 aa  111  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.69 
 
 
209 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  32.38 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.8 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.52 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  33.15 
 
 
212 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  30 
 
 
214 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3742  negative transcriptional regulator  36.06 
 
 
201 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  32.14 
 
 
216 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  32.34 
 
 
216 aa  109  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.19 
 
 
212 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.55 
 
 
209 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  32.97 
 
 
212 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.52 
 
 
212 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  30.37 
 
 
210 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.55 
 
 
212 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3679  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.71 
 
 
199 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  35.36 
 
 
207 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 
212 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>