99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3525 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3525  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 100 aa  200  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  90 
 
 		 199 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  90 
 
 		 199 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  89 
 
 		 199 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  85.86 
 
 		 219 aa  175  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  88 
 
 		 199 aa  175  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  84 
 
 		 201 aa  173  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  83 
 
 		 199 aa  167  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2362  FMN-binding negative transcriptional regulator  54.55 
 
 		 203 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  46 
 
 		 217 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  37 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  36 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  38 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.35 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  34.34 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1141  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.35 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  34 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.35 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.63 
 
 		 211 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.35 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  36.36 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.35 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5889  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  36.36 
 
 		 207 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 206 aa  52  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 209 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  34 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  32 
 
 		 209 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  31 
 
 		 202 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  39.73 
 
 		 207 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 207 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3661  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 244 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.1 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 227 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2838  negative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0668939  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.95 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  27 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  48.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 216 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  34.33 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 213 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  28 
 
 		 232 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 251 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 218 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  28.28 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  28.43 
 
 		 218 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  35.21 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  28.43 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3641  negative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.691719  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 207 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 218 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  29 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  26 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3679  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 216 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10108  Uncharacterized protein AN0679 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C154]  26.85 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3742  negative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 227 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 209 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3982  negative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.8 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  29 
 
 		 207 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>