133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3668 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  50 
 
 
208 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  46.5 
 
 
205 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.92 
 
 
211 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  41.03 
 
 
202 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  43 
 
 
208 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.55 
 
 
212 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.27 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  43.27 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  45.85 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.75 
 
 
207 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  42.51 
 
 
212 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1141  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.19 
 
 
212 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.27 
 
 
207 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  42.31 
 
 
218 aa  175  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.31 
 
 
218 aa  175  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.31 
 
 
218 aa  175  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  41.75 
 
 
212 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.48 
 
 
207 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  44.21 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  40 
 
 
214 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  41.26 
 
 
212 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  38.57 
 
 
213 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  40.3 
 
 
214 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.5 
 
 
227 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.84 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.65 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.93 
 
 
208 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.34 
 
 
207 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  42.41 
 
 
208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.28 
 
 
218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  40.51 
 
 
212 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  40 
 
 
212 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  41.03 
 
 
213 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  38.46 
 
 
217 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  38.46 
 
 
212 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.62 
 
 
216 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.24 
 
 
214 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.79 
 
 
211 aa  154  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.49 
 
 
212 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  38.94 
 
 
212 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.98 
 
 
209 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  36.79 
 
 
253 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  37.44 
 
 
216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.5 
 
 
223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  38.46 
 
 
212 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
212 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
212 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
212 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
212 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
212 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.9 
 
 
212 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.9 
 
 
212 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  37.26 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.95 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.95 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.04 
 
 
224 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  36.41 
 
 
212 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  40.2 
 
 
207 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  36.41 
 
 
212 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.44 
 
 
212 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  37.02 
 
 
212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  37.44 
 
 
232 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  36.49 
 
 
212 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.92 
 
 
212 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  35.86 
 
 
210 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.34 
 
 
209 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  34.11 
 
 
223 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50195  predicted protein  33.33 
 
 
221 aa  141  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273335  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.79 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.85 
 
 
216 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.65 
 
 
209 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.65 
 
 
209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.6 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  30.54 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  36.41 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  36.41 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  36.41 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.99 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0621  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.74 
 
 
196 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.609776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  36.41 
 
 
199 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.9 
 
 
204 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  35.92 
 
 
199 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.03 
 
 
202 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  34.12 
 
 
219 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.52 
 
 
201 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10108  Uncharacterized protein AN0679 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C154]  31.71 
 
 
251 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254579  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  30.58 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.61 
 
 
207 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.61 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0083  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.82 
 
 
200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06510  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
247 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.962435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.13 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.61 
 
 
207 aa  111  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.13 
 
 
207 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.13 
 
 
207 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  36 
 
 
201 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.39 
 
 
214 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.53 
 
 
217 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05600  Negative transcriptional regulator  28.65 
 
 
203 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.592075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>