139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3512 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  52.68 
 
 		 204 aa  222  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  46.04 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  45.5 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  45.5 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  46 
 
 		 207 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  45.5 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  45 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  45 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  44.12 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  44.12 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  44.12 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  44.61 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  43.63 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  43.48 
 
 		 219 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.02 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.92 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  38.73 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  38.73 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  38.73 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.3 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.81 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.11 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.81 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  35.24 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.27 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1141  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.44 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  32.65 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  32.65 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  34.36 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  33.49 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  34.47 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  33.02 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  31.79 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  30.61 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  33.65 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  33.85 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.75 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5889  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.99 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.79 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.65 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  34.43 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  34.43 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  34.64 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  29.65 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  33.18 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.8 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.08 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2362  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.87 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>